Origin入門教程（十九）：繪制熱圖

熱圖作為生物信息中一種常用的數(shù)據(jù)表現(xiàn)方法，可以簡單地匯聚大量數(shù)據(jù)，同時可使用一種相對應的漸變顏色來展示數(shù)據(jù)。這種方法可以很直觀地呈現(xiàn)空間數(shù)據(jù)的疏密程度或頻率高低。

常見繪制熱圖的方法有很多，如可用R包，OmicSare tools的熱圖工具，Heml等繪制。那么如何利用Origin繪制熱圖呢？讓我們來一起學習一下吧~

01

導入數(shù)據(jù)

把數(shù)據(jù)輸入到origin的sheet中；26個英文字母為26行，每一列的名稱以數(shù)字1~26命名（數(shù)據(jù)為隨機輸入）

02

繪制熱圖

①選中全部數(shù)據(jù)；②點擊Plot；③點擊Heatmap圖標的▼；④選擇Heatmap with labels（與Heatmap的區(qū)別為有無labels，labels可以在后續(xù)的設置中更改）

彈出Plotting: plotvm對話框，Data Layout 可以根據(jù)自己的需要選擇用X軸或Y軸表示，本文選擇Y across columns。其他參數(shù)一般默認即可。

示例圖：可以看到選擇Y across columns，則Long name 為Y軸。

03

美化

（1）調(diào)整圖形尺寸：雙擊圖形，彈出Plot Details對話框，在對話框左側選擇Layer 1，點擊對話框右側Size/Speed按鈕，對圖形的尺寸進行更改；

（2）更改Lables：雙擊圖形，彈出Plot Details對話框，在對話框左側選擇Sheet 1，點擊對話框右側Lable按鈕；

• 不勾選Enable，則在熱圖中無Labels。

• 勾選Enable，則顯示labels，并且可以對Labels的字體、字號、旋轉角度以及顏色等特征進行設置；

（3）更改填充顏色：雙擊圖形，彈出Plot Details對話框，在對話框左側選擇Sheet 1，點擊對話框右側Colormap按鈕，點擊Fill后彈出對話框，以3-Color Limiting Mixing為例，設置中間色為Yellow。點擊OK并應用，可以看到如下效果圖：

其他選項大家可以自己挖掘一下！

例如在Load Palette中有很多系統(tǒng)自帶的配色可供選擇。

（4）顏色刻度值和范圍：雙擊圖形，彈出Plot Details對話框，在對話框左側選擇Sheet 1，點擊對話框右側Colormap按鈕，點擊Level后彈出對話框。熱值范圍1~51，Major Levels默認5，為主刻度數(shù)。Minor Levels默認5，為中間插入的顏色數(shù)量，若改變Minor Levels會使得顏色漸變條更光滑。

比如Minor Levels設置200，Total也會隨之改變。

下圖分別是Minor Levels為5和200的熱圖，可以明顯的看出Minor Levels為200的熱圖顏色漸變條更光滑更自然。

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